电子显微镜是根据电子光学原理，用电子束和电子透镜代替光束和光学透镜，使物质的细微布局在非常高的放大倍数下成像的仪器。电子显微镜原理是将电子流作为一种新的光源，使物体成像。电子显微镜有带透射功效的电镜，台式大型的电子显微镜多用于医药实验室。

　　电子显微镜在农业上的使用

　　扫描电子显微镜在农业平台的使用扫描电子显微镜(SEM)具有景深大、图像立体感强、分辨率高、图像局限大以及样品制备历程相对简单等优点，已惹起农业科研人员的高度重视和钟情。扫描电镜在农业科研中主要是研究动植物、微生物、虫豸等不同组织和细小器官的表面形态及里面布局，从而加深理解它们在生理职能上的使用，探索有机体的生活规律。如：在虫豸利便主要是进步对其细小器官的辨别才气、进步分类水平，同时进一步弄清器官的作用，对虫豸的外部形态进行特性形貌和相对，研究其形状变更及其规律和布局的特性以便有更深的了。在植物方面，研究农作物的花粉、果皮、种皮表面斑纹及种子里面布局等特性，这在分类学上具有重要作用。在微生物方面，对研究真菌、放线菌、细菌的分类、辨别科属、校验病源等起较大的作用，尤其是对病菌的活动、孢子抽芽、侵入寄主等，用扫描电镜观察均能获得写意的效果。